Kantor Kementerian Agama Bukittinggi secara umum menahkodai seluruh unit kerja kementerian Agama Kota Bukittinggi. Saat ini Di kepalai oleh H. Abrar Munanda, S.Ag, M.Ag. Kantor Kementerian Agama Kota Bukittinggi terdiri dari 5 seksi sebagai berikut :
- Sub Bagian Tata Usaha
- Penyelenggara Haji & Umrah
- Bimbingan Masyarakat Islam
- Pendidikan Madrasah
- Pendidikan Diniyah & Pondok Pesantren
Adapun jumlah pegawai di lingkungan Kantor Kementerian Agama Kota Bukittinggi adalah sebagai berikut :
