Seksi Pendidikan Diniyah dan Pondok Pesantren atau yang disingkat PD. Pontren saat ini di kepalai oleh Drs. Tamrin M.Ag. secara umum Seksi PD. Pontren bertugas melaksanakan penyusunan bahan dan pelaksanaan kebijakan teknis, pelayanan, bimbingan teknis, pembinaan,pengelolaan data dan sistem informasi, dan penyusunan rencana, serta pelaporan di bidang pendidikan diniyah,diniyah takmiliyah, kesetaraan, Al-Quran, dan pondok pesantren berdasarkan kebijakan teknis yang ditetapkan oleh Kepala Kantor Wilayah Kementerian Agama provinsi.
Adapun jumlah PD Pontren yang ada di bukittinggi adalah sebagai berikut :
- Madrasah Diniyah Takmiliyah Awwaliyah (MDTA) berjumlah 40 lembaga.
- Pondok Pesantren berjumlah 4 lembaga.
- Taman Pendidikan Qur’an (TPQ) 40 lembaga.
- Rumah Tahfiz 16 lembaga